漢曉陽

Adam W. Hansen, PhD · 計算遺傳學家 · Geneial 創辦人暨執行長 · 休士頓

漢曉陽(Adam W. Hansen)在座談會上發言

我是計算遺傳學家,也是 Geneial 的創辦人暨執行長。我在貝勒醫學院(Baylor College of Medicine)取得博士學位,研究方向是罕見疾病的基因發現。現在,我打造研究基礎設施與 AI,協助病患、研究人員與療法開發者長期從健康資料中學習,同時不與提供資料的人失去聯繫。

背景與資料來源

我目前在做的事

自 2020 年起,我帶領 Geneial,打造我認為精準醫療一直缺少的東西:病患與研究其疾病的研究人員之間,一段長久的關係。

  • 病患登錄與自然病史研究:讓人們能持續參與多年,知情同意、問卷與後續追蹤都在同一個地方完成。
  • 縱貫性、可直接用於研究的資料:研究人員與療法開發者不必為每一項研究重新整理,就能直接分析。
  • AI 代理(AI agents):把病友家庭描述症狀的方式,以及格式雜亂的各種資料,轉換成研究可用的標準術語。

目前,包括 Xia-Gibbs 症候群與 HNRNP 相關疾病在內的病友社群,都在 Geneial 上運作他們的病患登錄。

從基因發現到 Geneial

我的母親是護理師,父親是發明家。我刻意選擇了一條結合兩者的路:用新的想法減輕病痛。從父親的工作中我學到,好點子只是開始,真正困難的是把它送到能因此受益的人手上。所以我跨足遺傳學、創業與醫療三個領域,去學習這件事要怎麼做到。

我的博士研究分析找出了 154 個候選致病基因。但很多時候我們無法再往前推進:臨床資料不完整,而當新的問題出現時,我們也沒有可靠的方法重新聯繫病友家庭。我們大部分的發現,始終沒能回到當初提供資料的家庭手中。

這正是我一直在準備解決的問題。Geneial 的第一個概念驗證,是與我受訓的實驗室合作完成的:在貝勒醫學院人類基因體定序中心,對 Xia-Gibbs 症候群病患登錄進行保護隱私的搜尋。我在研究所期間就曾參與這個病友社群的研究。如今,這個病患登錄就在 Geneial 上運作。

  1. 2016–2020 · 貝勒醫學院

    找出罕見疾病背後的基因

    在人類基因體定序中心 Richard Gibbs 的研究團隊攻讀博士。我整合了 18,696 位疑似孟德爾遺傳疾病轉介者的外顯子組資料,建立以基因為核心的分析方法,找出 154 個候選致病基因。後續論文描述了與 POLR2A 及 KIF1A 相關的疾病,我也參與了 Xia-Gibbs 症候群的研究。

    AJHG 2019BCM 新聞HGG Adv 2021
    12 位個案的 POLR2A 變異 沿著長度 1,970 個胺基酸的 POLR2A 蛋白質標示 11 個變異:9 個錯義變異、1 個位於第 438 個胺基酸附近的框內缺失,以及 1 個位於第 1814 個胺基酸的移碼變異。其中錯義變異 p.Asn1251Ser 出現在兩個人身上。 1 500 1000 1500 1970 POLR2A 胺基酸位置 p.Pro28Arg (c.83C>G) · 1 人 p.Arg108His (c.323G>A) · 1 人 p.Arg140Trp (c.418C>T) · 1 人 第 438 個胺基酸附近的框內缺失 (c.1314_1319del) · 1 人 框內缺失 p.Ala1092Val (c.3275C>T) · 1 人 p.Ser1094Phe (c.3281C>T) · 1 人 p.Thr1136Ile (c.3407C>T) · 1 人 p.Asn1251Ser (c.3752A>G) · 2 人 ×2 p.Gly1418Arg (c.4252G>A) · 1 人 p.Arg1603His (c.4808G>A) · 1 人 第 1814 個胺基酸的移碼變異 (c.5440_5441del) · 1 人 移碼變異
    圖 1. 在 12 位發展障礙患者身上發現的 POLR2A 變異,依其在蛋白質上的位置排列。資料來自我以第一作者發表於 HGG Advances(2021)的論文。
    資料
    變異cDNA位置類型人數
    p.Pro28Argc.83C>G28錯義變異1
    p.Arg108Hisc.323G>A108錯義變異1
    p.Arg140Trpc.418C>T140錯義變異1
    第 438 個胺基酸附近的框內缺失c.1314_1319del438框內缺失1
    p.Ala1092Valc.3275C>T1092錯義變異1
    p.Ser1094Phec.3281C>T1094錯義變異1
    p.Thr1136Ilec.3407C>T1136錯義變異1
    p.Asn1251Serc.3752A>G1251錯義變異2
    p.Gly1418Argc.4252G>A1418錯義變異1
    p.Arg1603Hisc.4808G>A1603錯義變異1
    第 1814 個胺基酸的移碼變異c.5440_5441del1814移碼變異1
  2. 2020 年起 · Geneial

    保護資料隱私的基礎設施

    罕見疾病資料稀少、分散,而且很容易被重新識別,所以隱私必須從一開始就內建,而不是事後補上。我是 Geneial 安全資料交換專利的共同發明人,這項技術能在不解密的情況下分析同態加密的資料;我也擔任 NIH 補助計畫的主持人,研究罕見疾病病患的隱私保護連結(NHGRI),以及由病患自主掌控的藥物基因體報告(NLM)。

    美國專利 12,417,301NHGRINLM
  3. 2022 年起 · Geneial

    讓人們能持續參與的研究

    為長期參與而設計的病患登錄與自然病史研究,從 Xia-Gibbs 症候群社群開始:電子知情同意、病患自填問卷與長期追蹤,產出研究人員真正能分析的資料。我們在 ASHG 2023 發表的這套登錄平台摘要,獲選為 Reviewers’ Choice(審查委員精選)。

    ASHG 2023Xia-Gibbs Society演講
    Xia-Gibbs 症候群病患登錄每年新增參與者 2016 至 2026 年的長條圖。2021 年以前每年約 11 至 22 人加入,2022 年起每年 33 至 42 人。2026 年尚未結束。總計 259 位參與者。 0 20 40 2016 年:新增 11 位參與者 11 2016 2017 年:新增 14 位參與者 2017 2018 年:新增 13 位參與者 2018 2019 年:新增 16 位參與者 2019 2020 年:新增 22 位參與者 2020 2021 年:新增 17 位參與者 2021 2022 年:新增 42 位參與者 42 2022 2023 年:新增 39 位參與者 2023 2024 年:新增 33 位參與者 2024 2025 年:新增 34 位參與者 2025 2026 年:新增 18 位參與者(年度尚未結束) 18 2026
    圖 2. Xia-Gibbs 症候群病患登錄每年新增的參與者。自 2016 年以來共有 259 人加入;2026 年尚未結束。資料來源:該登錄的公開儀表板,2026 年 10 月。
    資料
    年份新增參與者
    201611
    201714
    201813
    201916
    202022
    202117
    202242
    202339
    202433
    202534
    2026(未滿一年)18
  4. 2024 年起 · Geneial

    用於罕見疾病研究的 AI

    我的團隊參與由 RENCI 主導、與 NHLBI BioData Catalyst 合作、並由 ARPA-H 資助的資料標準化計畫,打造 AI 代理,把雜亂的研究資料轉換成標準、可分析的格式。其中的 GenOMA 能把罕見疾病問卷題目對應到人類表型本體(Human Phenotype Ontology)術語;這篇論文獲得 ML4H 2025 最佳論文獎。

    PMLRRENCI程式碼

我的觀點

  1. 終有一天,每一種疾病都會是罕見疾病。

    我們越了解一種疾病,它就越會分化成由基因與致病機轉定義的更小病症,每一種都有各自最適合的治療。癌症已經在走這條路。而最罕見的個案往往最有啟發:遺傳性高膽固醇血症的家族,帶領研究人員找到 PCSK9 這個基因,進而發展出一類全新的心血管藥物。罕見疾病,正是精準醫療的起點。

    Nat Genet 2003NEJM 2006ACC, 2015
  2. 我們的下一代,將會編輯 DNA 來預防與治癒疾病。

    新生兒基因體定序已經在英格蘭與紐約進行大規模試驗,我預期它終將在世界各地成為常規。第一個 CRISPR 療法已在 2023 年獲准上市。新的一代將在成長過程中運用自己的基因資料,活得更久、更健康。目前缺少的,是能長年追蹤每個人、了解遺傳或經過編輯的基因變化在一生中帶來什麼影響的基礎設施。這正是我投入的部分。

    Generation StudyJAMA 2025FDA, 2023
  3. 罕見疾病研究之所以停滯,是因為病患與研究人員失去了聯繫。

    病友家庭得向每一項新研究重述自己的故事,研究人員得從頭重建研究族群,而能讓下一個問題更容易回答的脈絡,就在這中間流失了。參與研究應該是一段超越單一研究的長久關係,而不是一次性的交易。

  4. 知情同意,只是資料自主權的第一個層級。

    資料自主權(data agency),指的是人們對自己的資料有多少決定權。我把它分成三個層級,而大多數研究停在第一層。每往上一層,就多贏得一分信任;而信任,正是讓人們願意長期參與、累積縱貫性資料的關鍵。

    1. 知情同意 同意自己的資料可以如何被使用,並可隨時撤回。
    2. 透明 看得見誰在使用自己的資料,以及用途為何。
    3. 掌控 每一次使用,都由自己決定同意或拒絕。
    HRPS 2024

精選論文

  1. An agentic approach to phenotype mapping from rare disease surveys Di J*, Vaughn JR*, Proulx J, Nordstrand S, Daines B, Ward KM, Lupo PJ, Hu J, Murugan M, Hansen AW. Proceedings of the 5th Machine Learning for Health Symposium (ML4H 2025), PMLR 297, 2026. 資深作者;*共同第一作者。我主導了這項研究背後的研發計畫。獲 ML4H 2025 最佳論文獎。
  2. Health equity innovation in precision medicine: data stewardship and agency to expand representation in clinicogenomics Silva PJ, Rahimzadeh V, Powell R, Husain J, Grossman S, Hansen A, Hinkel J, Rosengarten R, Ory MG, Ramos KS. Health Research Policy and Systems, 2024. 主張以病患為中心、保護隱私的資料管理。
  3. AHDC1 missense mutations in Xia-Gibbs syndrome Khayat MM, Hu J, Jiang Y, Li H, … Hansen AW, … Posey JE, Murdock D, Gibbs RA. Human Genetics and Genomics Advances, 2021. 十位個案中,有五位來自 Xia-Gibbs 症候群病患登錄。
  4. Germline mutation in POLR2A: a heterogeneous, multi-systemic developmental disorder characterized by transcriptional dysregulation Hansen AW, Arora P, Khayat MM, Smith LJ, … Lupski JR, Kaplan CD, Gibbs RA. Human Genetics and Genomics Advances, 2021. 第一作者暨共同通訊作者。
  5. Phenotypic expansion in KIF1A-related dominant disorders: a description of novel variants and review of published cases Montenegro-Garreaud X*, Hansen AW*, Khayat MM, Chander V, … Liu P, Lupski JR, Gibbs RA. Human Mutation, 2020. *共同第一作者;共同通訊作者。
  6. A genocentric approach to discovery of Mendelian disorders Hansen AW, Murugan M, Li H, Khayat MM, … Lupski JR, Boerwinkle E, Gibbs RA. American Journal of Human Genetics, 2019. 第一作者。從 18,696 人的外顯子組資料中找出 154 個候選致病基因。

所有論文、研討會摘要與研究計畫 · Google Scholar · ORCID

獎項與服務

媒體報導

演講

我的演講與座談主題包括:

  • 罕見疾病的基因發現,以及如何把候選基因變成確定診斷
  • 同時服務病患、研究人員與療法開發者的病患登錄與自然病史研究
  • 隱私、知情同意,以及讓病患掌控自己的基因體與健康資料
  • 用於表型分析與研究資料標準化的 AI 代理
  • 身為科學家創辦人,如何以 NIH SBIR 與 STTR 補助建立公司
漢曉陽在 MedTech Malta 2025 的四人精準醫療座談中發言,背後螢幕顯示座談主題與與談人
精準醫療座談,MedTech Malta 2025
漢曉陽在奧斯汀的兒童心理健康峰會上,站在講台主持三人座談
主持資料基礎設施座談,兒童心理健康峰會,奧斯汀,2025

精選演講與座談

所有演講與座談

工作之外

從高中起,音樂就一直是我生活的一部分;當時我入選了新罕布夏州的 All-State 高中榮譽爵士樂團。我的樂團 Pändo 的作品可以在 Trembling Giant(Apple Music)和 Vagabond EP(Spotify)聽到。我會打鼓、彈鋼琴、吉他、貝斯和 Suzuki Omnichord,手邊任何打擊樂器或弦樂器,包括烏克麗麗,我幾乎都會拿起來玩。

過去四年,我在所屬的教會擔任志工,為母語是中文的朋友開設英語課程。我會說中文和西班牙文,也喜歡籃球、旅行、下廚,以及認識不同的文化。

漢曉陽在舞台上打鼓,在銅鈸後方微笑 漢曉陽雙手抱胸,站在布滿塗鴉的水泥牆前 翠綠的海岸峭壁,延伸入湛藍的大海

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